Séminaire de Probabilités et Statistique

Le lundi 03 juillet 2017 à 13:45 - UM - Bât 09 - Salle de conférence (1er étage)

Amandine Veber
Savoir prendre de bonnes résolutions

Dans cet exposé, on s'intéresse à l'inférence de paramètres décrivant la démographie d'une population à partir de l'observation de la diversité génétique au sein d'un échantillon. Dans le type de modèles que l'on considère, les statistiques décrivant la diversité génétique au sein de l'échantillon (nombre de mutations, répartition de ces mutations entre les individus) dépendent d'une résolution plus ou moins grossière de l'arbre généalogique (caché) qui relie les individus. Considérer la résolution optimale permet alors d'améliorer nettement l'exploration de l'espace des généalogies possibles lors du calcul de la vraisemblance des paramètres démographiques, par rapport aux méthodes classiques faisant appel à des arbres étiquetés de type coalescent de Kingman.

Travaux en collaboration avec R. Sainudiin, J. Palacios, S. Ramachandran et J. Wakeley.



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